<button id="jmnxo"></button>

    <rp id="jmnxo"></rp>

    <form id="jmnxo"></form>

      <tbody id="jmnxo"><noscript id="jmnxo"></noscript></tbody>

      1. 聯系我們
        地址:慶市川區道(原雙竹鎮)
        13983250545

        信:ycsh638

        QQ:469764481
        郵箱:ycsh6318@163.com

        論文:重慶養殖場鱖群體微衛星遺傳多樣性研究

        發表時間:2024/02/03 20:31:28  來源:水產養殖 2023年7期  瀏覽次數:839  
        字體大小: 【小】 【中】 【大】
        西南漁業網-豐祥漁業網秉承:求是務實不誤導不夸大不炒作!水產專業網站為您提供優質服務!【鄭重提醒】:本站所有文章,如需轉載請注明出處,否則謝絕轉載??!謝謝合~
        市場在變,我們的誠信永遠不會變!

        重慶養殖場鱖群體微衛星遺傳多樣性研究

        范士琦,馮婧昀,苗曉敏,郭慧,陶怡曦,李云

        (1.西南大學水產學院,漁業與水產生物技術實驗室,重慶 400715;2.西南大學淡水魚類資源與生殖發育教育部重點實驗室,重慶市水產科學重點實驗室,重慶 400715)

        鱖(Siniperca chuatsi)俗稱桂花魚、翹嘴鱖,隸屬于硬骨魚綱(Osteichthyes),鱸形目(Perciformes),科(Serranidae),鱖亞科(Siniperinae),鱖屬(Siniperca),廣泛分布于中國長江和黑龍江水系及其附屬湖泊水庫以及朝鮮半島、越南部分地區,為名貴水產品[1-3]。2020 年我國鱖養殖的總產量達37 萬t,廣東生產的鱖苗種占全國的95%以上[3]。鱖作為重要養殖魚類,國內學者對其形態特征、養殖性能、種質資源、生理機能、遺傳育種等方面開展了廣泛研究[4-8],取得了豐富的成果,目前已經報道的鱖新品種有“華康1 號”“長珠雜交鱖”“廣清1號”“鼎鱖1 號”等[9-12]。盡管長江流域有著豐富的天然鱖種質資源,但位于長江上游的川渝地區鱖養殖產業起步較晚。近幾年,重慶市鱖消費市場需求旺盛,鱖苗種需求持續增加,外購苗種質量不穩定,加上長途運輸易產生應激反應,養殖風險大,制約了重慶鱖養殖業的發展[13]。

        遺傳多樣性可以直接體現種群長期進化和發展中的遺傳變異,因此開展魚類遺傳多樣性的研究,可為了解魚類的種質資源現狀和遺傳改良奠定基礎[14-15]。微衛星標記技術是目前發展最快的一類分子標記,在魚類遺傳發育、DNA 指紋圖譜制作分析、遺傳連鎖圖譜構建和標記輔助選擇中廣泛使用[8]。微衛星DNA 在真核及原核生物基因組中被普遍應用,其特點相較于其他諸如RFLP、RAPD、AFLP 分子標記技術而言,多態性更高[16-17]?,F通過微衛星DNA 遺傳多樣性,對重慶地區3 個養殖場的鱖群體的遺傳多樣性和遺傳結構進行分析評價,擬為重慶鱖養殖種質資源調查提供基礎數據,為優質苗種生產提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        活體鱖采自重慶市潼南區興水養殖場(XS)、名優魚養殖場(MY),以及重慶市巫溪縣鱖養殖場(WX)。3 個群體樣本的外部形態特征和可數性狀標準均符合《鱖》(SC 1038—2000)的分類特征。各養殖場均隨機采集樣本50 尾,分別測量體高和體長。其中,MY 養殖場鱖平均體質量為(73.76±20.16)g,平均體長為(14.21±1.09)cm;XS 養殖場鱖平均體質量為(49.60±14.91)g,平均體長為(12.79±1.50)cm;WX 養殖場鱖平均體質量為(32.94±7.25)g,平均體長為(11.03±0.77)cm。捕撈后立即取尾鰭固定在95%乙醇中,于-80 ℃冰箱保存備用。

        1.2 微衛星DNA 標記

        所有鱖樣本基因組DNA 提取均采用酚-氯仿抽提法[18]。根據文獻[19-21],篩選出23 對鱖微衛星引物(由上海生工合成)。從3 個鱖群體中分別任選2 尾鱖的模板DNA 與23 對引物進行PCR 擴增篩選出10 對擴增效率高、多態性較好的引物(表1),并合成熒光基團標記引物(上海生工)。

        表1 10 對熒光引物基本信息

        其中,微衛星引物JX867997、JX867983、JX867992參考文獻[20],另外7 個引物參考文獻[19,21]。10對引物的正向引物(5′端)添加HEX(藍色)或FAM(綠色)或TAMRA(黑色)熒光標記,反向(3′端)不添加,然后分別與模板DNA 進行PCR 擴增反應。并通過ABI3730XL 遺傳分析系統對產物進行STR 分型。

        1.3 數據處理

        采用Genemapper 軟件,分析SSR 數據,統計分析包括等位基因數(Na)、有效等位基因數(Ne)、觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、香農威納指數(H′)、基因流(Nm)、基因分化系數(FST)等參數;哈迪溫伯格平衡(Hardy-Weinberg)檢驗遺傳距離和遺傳相似系數;使用PIC_Calc 0.6 軟件計算多態信息含量(PIC)。

        2 結果與分析

        2.1 群體遺傳多樣性

        用10 個多態性好的微衛星引物共檢測到95個等位基因(表2),Na為4~22,均值為9.5。就PIC而言,DQ789300 的多態性為中度(0.25<PIC<0.5)外,另外9 個多態性位點均有高度多態性(PIC>0.5)。10 個微衛星位點FIS值為-0.390 9~0.146 9,FIT值為-0.339 4~0.188 6,平均值為-0.051 8;FST值為0.012 2~0.087 6。就Nm而言,除了DQ789391 的值<4 外,其微衛星位點的Nm值均>4。

        表2 10 個微衛星位點的固定指數(F)和Nm①

        篩選出的10 個微衛星位點在3 個鱖群體中的遺傳多樣性參數見表3。由表3 可見,鱖群體的Na均值為6.4~7.4,Ne均值為3.635~3.767,Ho均值為0.733~0.755,各群體He均值為0.674~0.711。3 個鱖群體I 均值為1.378~1.427,其中XS 群體最低,MY群體最高。

        表3 3 個鱖群體微衛星遺傳多樣性參數①

        2.2 群體遺傳結構

        3 個鱖群體間遺傳相似系數(對角線上)和遺傳距離(對角線下)見表4。由表4 可見,不同鱖群體間的遺傳距離值為0.087 1~0.136 0,遺傳相似系數值為0.889 5~0.916 6,>0.05,其中MY 群體與XS 群體間相似系數值(0.916 6)高于MY 群體與WX 群體間遺傳相似系數(0.872 8)。對重慶地區3 個鱖群體的分子方差分析結果表明(表5),95.44%的遺傳變異來自個體內,4.47%的變異來自群體間,群體內變異組成為0.09%。

        表4 3 個鱖群體間遺傳相似系數(對角線上)和遺傳距離(對角線下)

        表5 3 個鱖群體的分子方差分析(AMOVA)

        3 討論

        3.1 3 個鱖群體的遺傳多樣性

        微衛星標記分析遺傳多樣性會受到種群樣本量的影響,通常認為用于微衛星標記研究的樣本量在≥20 個時,才能穩定反映出等位基因和有效基因數[22]。本試驗的各群體的樣本量為50 尾,可以反映出3 個鱖群體間的遺傳變異程度。Buchanan 等[23]研究發現,高度多態表現為PIC>0.5,中度多態時PIC值為0.25~0.50,而PIC<0.5 時,則為低度多態;另外,微衛星位點選擇標準是等位基因數在4 個以上[24]。本研究中,除了DQ789300 位點屬于中度多態外,其余9 個微衛星位點的PIC 均在0.5 以上,屬于高度多態;從Na來看,除DQ789300 外,其余微衛星位點的Na均≥4,能將群體遺傳變異程度很好表現出來。

        本研究所使用的微衛星位點所獲得的遺傳分析結果是可靠的,引物JX867983、JX867992 和JX86997,在150 個樣本中觀察到的等位基因數為7~11 個,低于文獻[25]運用相同引物對3 種鱖屬魚類進行遺傳分析所得到的等位基因數(11~19 個),這可能與本研究樣本為同種樣本有關。

        本研究中,MY、XS、WX 群體的Na和Ne平均值分別為6.4,7.4,6.9 和3.675,3.635,3.767,不同群體之間差異較小。Na平均值與李珊[26]對清水江野生斑鱖群體的研究結果相差不大(Na=3.668 0)。Takezaki等[27]通過微衛星分析得出,群體間有遺傳多樣性表現在雜合度為0.3~0.8。MY、XS、WX 群體的平均Ho和He分別為0.733、0.755、0.736 和0.711、0.682、0.674,雜合度較高,群體變異豐富[18]。彭敏燕等[28]在對3 個鱖野生群體的微衛星遺傳多樣性研究中得出平均Ho和He分別為0.255 4~0.698 9 和0.710 0~0.744 6,低于本研究中群體結果平均Ho,稍高于本研究群體平均He值。從H′來看,各群體均值為1.378~1.427,高于梅秋蘭等[29]對鱖原種群體和鱖群體使用微衛星技術研究得出的H′均值(1.078 和0.689)。本研究中,重慶市3 個鱖群體遺傳多樣性較高,提示3 個鱖養殖群體苗種來源的親代繁育群體數量較大,遺傳異質性較高,也反映出苗種產地人工選擇壓力小等原因[30]。

        3.2 3 個鱖群體間的遺傳結構

        固定指數是研究遺傳分化的重要指標,它包括FIT、FIS和FST3 種參數[31-32]。其中,FIS表示群體偏離隨機交配的程度,當FIS<0 認為群體在該位點存在雜合子過?,F象,FIS>0,則表示雜合子缺失,FIS=0 時,即為達到平衡[33]。在本研究中,除了W19518、DQ789290、DQ789391 位點FIS>0 外,其他位點的FIS均<0,表明存在雜合子過剩,異交程度高。群體間的遺傳分化程度可以通過FST揭示出來,分化程度較小時FST<0.05,分化程度中等時為0.05~0.15,當FST>0.15 時,表示群體間的分化程度高[34]。本研究中,有70%的微衛星位點的FST值均<0.05,表明3 個群體間的分化程度低。針對Nm而言,一般認為如果Nm>1,則表示不會有顯著的遺傳分化,當Nm>4 時,則被認為分化程度很小[35],本研究中,各位點的Nm均>4,也證明3 個鱖群體間均未出現遺傳分化現象。而根據AMOVA 來看,個體內部變異(95.44%)是遺傳變異的最主要源頭,群體間的變異程度僅占4.47%,這也符合FST得出的分析結果。

        研究群體多樣性的重要因素之一是遺傳距離的大小,其與群體分化時間成正相關[36]。根據3 個鱖魚群體間的遺傳相似度、遺傳距離數據,MY 群體與XS 群體遺傳相似度最大(0.916 6),且遺傳距離最短,而WX 群體與其他2 個群體的遺傳相似度略小,遺傳距離略大。文獻[37]表明,同種間的群體遺傳相似度為0.80~0.97,遺傳距離為0.03~0.20。本研究結果顯示,遺傳相似度為0.872 8~0.916 6,遺傳距離為0.087 1~0.136 0,可判定3 個群體為同一物種,且群體分化時間短。根據調查,XS、WX2 個群體苗種分別來源于廣東清遠、佛山,MY 群體屬于重慶本地儲養親體的自繁苗種,其親體從廣東佛山引入,提示3 個群體的親本可能來源于共同的祖代群體,也與廣東鱖(翹嘴鱖)的養殖祖代群體于1980 年代引自長江中下游的歷史相吻合[1,3]。

        許多研究發現,養殖群體比野生群體發生瓶頸效應和種質同質化的可能性更大,這些都會導致遺傳基因的丟失和群體遺傳性的降低。在對來自湘江的野鯉養殖群體和野生群體的研究中發現,2 個群體間的遺傳變異水平很大[38];趙祥等[39]研究后發現,對比野生群體來看,黃姑魚養殖群體的遺傳多樣性降低十分顯著。在對鱖的遺傳多樣性研究中,方展強等[40]研究得出鱖養殖群體與野生群體之間遺傳差異十分顯著,養殖群體要顯著低于野生群體;梅秋蘭等[30]也基于微衛星對鱖養殖群體和原種群體的遺傳差異進行了分析比較,得出鱖原種群體遺傳多樣性較為豐富的結論。因此,在原種場親本群體和后備群體的選擇時,選擇遺傳距離相對較遠的親本,并開展群體遺傳多樣性分析,對保持親本群體的遺傳多樣性非常有必要性[41]。

        4 結語

        本研究運用微衛星標記對重慶3 個鱖養殖群體進行分析,結果表明,3 個鱖群體內的遺傳多樣性較高,群體間的遺傳分化水平低,表明3 個群體內保留有較高的遺傳異質性,群體間有較近的親緣關系,反映了群體親本源自共同的祖代。在生產中,要提高苗種質量、存活率和養殖性能,需加強親本選育過程的遺傳選擇壓力,提高已育成良種的生產力和覆蓋率。

        聲明:轉載文是出于傳遞更多信息之目的。若有標注錯誤或侵犯了您的合法權益,請與本網聯系,我們將及時更正、刪除,謝謝!
        “養魚第一線”微信公眾訂閱號頭條@漁人劉文俊

        "養魚第一線"微信公眾帳號和頭條號!將會定期向你推送本號信息!將為你精誠服務!

        文章評論
        發表評論:(匿名發表無需登錄,已登錄用戶可直接發表。) 登錄狀態: 未登錄,點擊登錄
        電腦網址: http://www.dollarslicenewyork.com 地址:重慶市永川區衛星湖街道  手機網址:http://m.yc6318.cn
        重慶市永川區雙竹漁業協會,重慶市永川區水花魚養殖專業合作社,重慶吉永水產品養殖股份合作社,重慶市永川區豐祥漁業有限公司
        本站,微信:ycsh638,QQ:469764481,郵箱:ycsh6318@163.com

        ICP備案/許可證號渝ICP備2020014487號-1

        渝公網安備50011802010496號

        誠信共建聯盟

        日韩久久久久精品一区二区三区,日韩久久久久精品一区二区三区,引诱亲女乱小说录目伦,亚洲国产成人精品青青草原

        <button id="jmnxo"></button>

          <rp id="jmnxo"></rp>

          <form id="jmnxo"></form>

            <tbody id="jmnxo"><noscript id="jmnxo"></noscript></tbody>